古细菌病毒的多样性、生态学和进化

古生菌的一个显著特征是其病毒的显著多样性。古细菌病毒是全球病毒圈中最未被探索和神秘的部分之一。许多古菌病毒与细菌或真核生物的病毒没有共同的进化关系、结构特征或基因组特征。最近的培养和基于宏基因组学的研究发现了几种新的病毒组，它们可以感染不同生境中的古细菌极端微生物和嗜微生物。病毒生态学研究揭示了古菌病毒在影响微生物群落，特别是在水生生态系统中的重要作用。由于许多古菌病毒在极端物理化学条件下的稳定性，它们也是遗传工具开发的良好候选者。

本研究课题的目标是促进古菌病毒研究的最新进展的出版物。尽管进行了开拓性的研究，但古生菌病毒的巨大多样性及其与宿主的相互作用仍然很少被探索。从环境中分离古细菌病毒粒子的方法首先受到难以培养其古细菌宿主的阻碍。宏基因组测序揭示了大量来自环境的潜在病毒序列。其中相当一部分可能属于古菌病毒。然而，由于古菌病毒的参考数据库非常小，这些序列很少能被成功分类。元转录测序数据相对稀缺，因此RNA古菌病毒的发现滞后。古菌病毒在形态上的多样性远高于噬菌体，这表明前者的起源历史复杂。这也意味着它们在与宿主细胞相互作用时可能具有独特的病毒粒子结构和机制，例如它们的生命周期和新颖的防御/反防御系统。初步研究表明，古菌病毒在深海沉积物元素循环和调节人类肠道健康方面发挥着至关重要的作用，但它们对生态和生理的潜在影响仍有待发现。

古菌病毒研究中的重要科学问题包括其整体多样性的准确估计、其多重起源和分类、具有典型或非典型病毒粒子结构(如包膜)或生命周期的古菌病毒、古菌宿主及其病毒的新型防御系统和反防御系统、RNA病毒和逆转录病毒、阿斯加德古菌病毒、古菌-病毒相互作用机制及其生态贡献。我们还鼓励提交基于古菌病毒发现的分子工具、病毒分离的现场或实验室技术、单细胞/病毒方法以及用于病毒(元)基因组和进化研究的生物信息学工具的开发。欢迎原创研究，评论或方法文章。