植物相关微生物:多样性、系统学和基因组学

植物相关微生物(细菌、真菌和病毒)对全球农业产生积极和消极影响。这种关联是复杂和动态的，微生物群落随着关键的环境和人为因素而有规律地变化。一般来说，生态系统中植物-微生物的结合或相互作用在本质上可以是有益的，也可以是致病的。微生物可以通过直接和/或间接机制为植物健康和生产力提供益处，如根瘤菌通过固定大气氮提供的氮利用率提高，菌根真菌的营养转移，缓解压力，对抗病原体的活性和刺激生长。然而，在全球范围内，致病关联对植物生长和产量损失是有害的。据预测，气候变化(高温和大气二氧化碳水平)将导致病原体转移到新的农业气候区，从而在新的地区发生新的疾病复合体。植物相关有益和致病微生物的准确鉴定和分类以及遗传组成是其作为改善植物健康和生产力的候选菌株成功部署的关键，或者是选择有效的植物新老病害管理策略的关键第一步。

在本研究课题中，我们鼓励提交关于有益和致病植物相关细菌、真菌和病毒的多样性、分类学/系统学和基于基因组的鉴定的手稿，为该领域提供有价值的科学见解或贡献。随着下一代测序技术的出现，加上可靠的生物信息学工具，基于基因组的研究受到鼓励，但至少有7个基因的多位点序列分析(MLSA)也是可以接受的。

我们欢迎原创研究，评论，迷你评论，方法或意见文章。如果涉及新类群的稿件包含基因内容的深入分析数据，如效应子、分泌系统、次生代谢产物等，将被考虑。

我们鼓励就以下主题提交意见，但不限于:
•植物相关有益和致病细菌、真菌或病毒多样性的系统发育和基于基因组的分类学/系统学研究;
•未经培养的植物相关细菌、真菌或病毒的基因组和宏基因组研究。

关键字:植物相关微生物，系统发育，系统基因组学，细菌多样性，分类学，真菌多样性，病毒多样性

重要提示:所有对本研究主题的贡献必须在其所提交的章节和期刊的范围内，如其使命声明中所定义的那样。在同行评审的任何阶段，Frontiers保留将超出范围的稿件引导到更合适的章节或期刊的权利。