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利用充分研究的模式生物(如果蝇、非洲爪蟾和鸡)进行的比较研究,对关键基因家族的免疫学新奇性和差异以及确定一组核心免疫成分进行了富有成效的深入了解。高通量方面的最新进展…

利用充分研究的模式生物(如果蝇、非洲爪蟾和鸡)进行的比较研究,对关键基因家族的免疫学新奇性和差异以及确定一组核心免疫成分进行了富有成效的深入了解。高通量测序技术的最新进展导致了使用非模式生物的探索性免疫学研究,其中几乎没有预先存在的知识,从而在比较免疫学领域实现了重大飞跃。F.例:(脊椎动物)免疫学的中心信条受到挑战,因为硬骨鱼的三个不相关家族中缺乏II类主要组织相容性复合体,无颚鱼通过可变淋巴细胞受体存在适应性免疫,被囊动物存在先天记忆,以及提出的模式识别受体多样性与适应性免疫之间的去耦关系。迄今为止发表的大多数关于水生物种的比较研究都是在淡水/溯河物种中进行的,与水产养殖业(如鲑鱼和鲤鱼)和/或模式物种(如斑马鱼和鳉鱼)有关。与此同时,有必要更详细地了解高度多样化的海洋生物群体的免疫情况,这一群体涵盖了从微生物到无脊椎动物和脊椎动物的大量生物。迄今为止,已描述的海洋物种约有23万种,但据估计,尚未被识别的海洋物种大约是这个数字的10倍。此外,大多数免疫学的发现,如在。硬骨鱼,通常是描述性的,只与近亲(即其他鱼类)相比-而不是放在更广泛的进化背景下(与无脊椎动物和/或软骨谱系相比)。最后,由于缺乏现成的实验工具和试剂,对于非模式生物的功能推断几乎缺乏,并且严重依赖于哺乳动物的推断。

通过本研究课题,我们希望突出海洋比较免疫基因组学和适应性免疫进化中的新的前所未有的机会。到目前为止,越来越多的全基因组测序计划为我们提供了新的和有价值的见解,以了解局部适应特定环境条件的分子过程,并对颌口进化有了新的见解。因此,我们正在进入一个具有不可预见的可能性的免疫学研究时代,基因组学可以提高对免疫的遗传基础的洞察,无论栖息地如何,有助于规划功能研究,并且可以从比以前更多样化的基因组资源的角度来看待功能发现。

我们欢迎在基因组学、转录组学、功能分析以及比较和进化研究领域调查免疫系统过程(基本)机制的研究,我们的目标是促进我们对海洋生物(从无脊椎动物到颚形脊椎动物)免疫过程的理解,将研究结果放在比较和进化的背景下。

本课题的研究范围包括以下海洋生物的研究:

-不同“适应性”策略的比较和/或功能研究,例如可变淋巴细胞受体,MHC损失,免疫球蛋白损失等。
-群体无脊椎动物自我/非自我歧视机制的比较和/或功能研究,包括异体识别
-任何海洋物种记忆机制的比较和/或功能研究
-描述与适应性免疫相关的(新)基因家族,重点是任何海洋物种的假定功能和多样性
-关键免疫基因及其产物的功能特征
-免疫细胞关键谱系的功能特征,如抗原提呈细胞和淋巴细胞
-跨血统的比较基因组学和进化研究

重要提示:所有对本研究主题的贡献必须在其所提交的章节和期刊的范围内,如其使命声明中所定义的那样。在同行评审的任何阶段,Frontiers保留将超出范围的稿件引导到更合适的章节或期刊的权利。

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